CIENCIA. El nuevo método 'CRISPR-Combo' aumenta el poder de edición del genoma en las plantas

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A la izquierda: brotes de álamo que contienen el gen editado por CRSPR. A la derecha, brotes de álamo con la misma edición CRSPR más mejoras genéticas para mejorar el crecimiento. Fuente: UMD

Hace diez años, una nueva tecnología llamada CRISPR-CAS9 hizo posible que los científicos cambiaran el código genético de los organismos vivos. Por revolucionaria que fuera, la herramienta tenía sus limitaciones. 

Al igual que los primeros teléfonos celulares que solo podían realizar una función, el método CRISPR original puede realizar una función: eliminar o reemplazar genes en una secuencia genética. Se desarrollaron iteraciones posteriores de CRISPR para otra función que permitía a los científicos cambiar la expresión génica encendiéndolas o apagándolas, sin eliminarlas del genoma. Pero cada una de estas funciones solo podría realizarse de forma independiente en las plantas.

Ahora, científicos de la Facultad de Agricultura y Recursos Naturales de la Universidad de Maryland han desarrollado CRISPR-Combo, un método para editar múltiples  en  y al mismo tiempo cambiar la expresión de otros genesEsta nueva herramienta permitirá combinaciones  que trabajan juntas para impulsar la funcionalidad y mejorar la reproducción de nuevos cultivos.

Las posibilidades, en principio, parecen ser realmente ilimitadas en términos de los rasgos que se pueden combinar. Pero lo que es realmente importante es que CRISPR-Combo introduce un nivel de sofisticación en la ingeniería genética en plantas que no habíamos tenido antes. La nueva investigación aparece en la edición de mayo de 2022 de la revista Nature Plants.

Los beneficios de manipular más de un gen a la vez pueden superar con creces los beneficios de cualquier manipulación por sí sola. Por ejemplo, imaginemos una plaga que arrasa los campos de trigo y amenaza el sustento de los agricultores y la seguridad alimentaria. Si los científicos pudieran eliminar un gen del trigo que lo hace susceptible al tizón y, al mismo tiempo, activar genes que acorten el ciclo de vida de la planta y aumenten  , podrían producir rápidamente trigo resistente al tizón antes de que la enfermedad tuviera la oportunidad de hacer demasiado daño.

Prueba de concepto

El equipo investigador había desarrollado previamente nuevos métodos CRISPR para regular  en plantas y editar múltiples genes al mismo tiempo. Pero para desarrollar CRISPR-Combo, tuvieron que establecer que podían realizar ambas funciones de ingeniería genética en paralelo sin consecuencias negativas. En este nuevo artículo, lo demostraron usando células de tomate y arroz.

Los investigadores probaron CRISPR-Combo en una  llamada rockcress (ArabidopsisI), que se suele utilizar como modelo para cultivos básicos como el maíz y el trigo. Los investigadores editaron un gen que hace que la planta sea más resistente a los herbicidas mientras activan un gen que provoca la floración temprana, lo que produce semillas más rápidamente. El resultado fue una planta de berro resistente a los herbicidas que produjo ocho generaciones en un año en lugar de las cuatro habituales.

Ingeniería más eficiente

Para su tercer experimento, el equipo demostró cómo CRISPR-Combo podría mejorar la eficiencia en el cultivo de plantas utilizando cultivos de tejidos de álamos. Los programas de mejoramiento para desarrollar nuevas variedades de plantas generalmente usan cultivos de tejidos en lugar de semillas; considere cómo una planta puede volver a crecer raíces y hojas a partir de un solo tallo plantado en el suelo. 

Los científicos modifican genéticamente las células madre que tienen la capacidad de convertirse en plantas completas, y cuando esas plantas maduren y produzcan semillas, las semillas continuarán con las modificaciones genéticas realizadas en las células madre.

Algunas plantas son mejores para regenerarse a partir de cultivos de tejidos que otras, lo que hace de este paso el cuello de botella más grande en la ingeniería genética de cultivos. Para algunas plantas, la tasa de éxito es solo del 1%.

Los científicos abordaron el cuello de botella editando primero algunos rasgos en las células de álamo y luego activando tres genes que promueven la regeneración del tejido vegetal. Demostraron en los álamos que el nuevo método podría ofrecer una solución al cuello de botella de la regeneración de tejidos, aumentando drásticamente la eficiencia de la ingeniería genética.

Atajo sin hormonas

Actualmente, el cultivo de plantas modificadas genéticamente a partir de cultivos de tejidos requiere la adición de hormonas de crecimiento, que activan los genes promotores del crecimiento. El equipo de investigación acorta este proceso en el arroz activando directamente estos genes con CRISPR-Combo. 

El resultado fue arroz editado genéticamente a partir de cultivos de tejidos que no requerían suplementos hormonales. Descubrieron que los cultivos de tejidos cultivados con su método expresaban más del gen editado que el tejido cultivado con hormonas. Este método da como resultado un proceso de edición del genoma altamente eficiente.

Ahora que el equipo ha demostrado que su método CRISPR-Combo funciona en una variedad de plantas para múltiples propósitos, tienen la intención de realizar experimentos en cítricos, zanahorias y papas para probar su viabilidad en una fruta, verdura y cultivo básico. También están trabajando para crear un arroz dorado resistente a los herbicidas con un contenido nutricional mejorado y un arroz rojo con más antioxidantes.

Más información: Changtian Pan et al, Boosting plant genome editing with a versatile CRISPR-Combo system, Nature Plants (2022). DOI: /10.1038/s41477-022-01151-9, www.nature.com/articles/s41477-022-01151-9.epdf

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La Crónica del Henares: CIENCIA. El nuevo método 'CRISPR-Combo' aumenta el poder de edición del genoma en las plantas
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