SALUD. La resistencia a los antimicrobianos en bacterias alimentarias: un desafío persistente para la salud pública europea en 2023-2024

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24 febrero 2026.- La resistencia a los antimicrobianos se mantiene como una de las amenazas más críticas para la salud pública y la sanidad animal a nivel mundial. El reciente informe resumen de la Unión Europea sobre la resistencia a los antimicrobianos en bacterias zoonóticas e indicadoras, correspondiente al periodo 2023-2024, arroja luz sobre la evolución de este fenómeno. 

Elaborado conjuntamente por la Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria y el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades, el documento analiza un ingente volumen de datos recopilados en 27 Estados miembros, además de otros países europeos asociados. El foco se centra en patógenos zoonóticos clave, como Salmonella spp. y Campylobacter spp., así como en bacterias indicadoras como Escherichia coli, Enterococcus spp. y Staphylococcus aureus resistente a meticilina. 

A través de un enfoque integral de "Una sola salud", los resultados evidencian que, si bien se han logrado avances alentadores en la reducción de la resistencia en animales de granja durante la última década, las bacterias transmitidas por los alimentos continúan mostrando niveles de insensibilidad alarmantes frente a fármacos de uso común y de importancia crítica para la medicina humana. La conmemoración de los diez años de vigilancia armonizada subraya la magnitud del esfuerzo institucional para estandarizar la recopilación de datos, lo que permite en la actualidad rastrear tendencias y establecer estrategias de intervención rigurosas.

Análisis de la información

La persistencia de altos niveles de resistencia a los antimicrobianos en bacterias como Campylobacter y Salmonella pone de manifiesto la enorme complejidad de erradicar este problema, el cual está profundamente arraigado en las prácticas de producción agroalimentaria y en la presión selectiva ejercida por el uso histórico de antibióticos. El hallazgo epidemiológico más contundente radica en la resistencia extremadamente alta a las fluoroquinolonas, como la ciprofloxacina. 

Esta situación ha forzado a las autoridades sanitarias a determinar que estos fármacos ya no pueden recomendarse como tratamiento empírico de primera línea para las infecciones por Campylobacter en humanos. Este hecho representa una pérdida tangible e inmediata de arsenal terapéutico, obligando a los profesionales médicos a recurrir a alternativas, como los macrólidos, cuya resistencia también requiere de una estricta monitorización sistemática.

Por otro lado, el análisis de las tendencias temporales a largo plazo (2014-2024) revela una clara dicotomía en la eficacia de las políticas de control implementadas. Mientras que los indicadores de resultados clave muestran un aumento estadísticamente significativo en la susceptibilidad completa a los fármacos en cepas de E. coli indicadora procedentes de animales de granja, se observa al mismo tiempo un estancamiento reciente en estas tendencias positivas, especialmente en las poblaciones de aves de corral. 

Este aplanamiento en las curvas de mejora sugiere que las intervenciones iniciales de restricción y uso prudente de antibióticos han surtido un efecto notable, pero que alcanzar reducciones adicionales requerirá en el futuro de estrategias mucho más incisivas. Además, la detección continua de genes de resistencia a cefalosporinas de tercera generación y carbapenémicos, subraya el riesgo constante de transferencia genética horizontal a través de la cadena de suministro alimentario.

La situación epidemiológica de Salmonella spp.

Salmonella continúa siendo un agente zoonótico de máxima prioridad. Los datos recopilados en 2024 revelan que una alta proporción de los aislados obtenidos de casos clínicos humanos mostraron resistencia a antimicrobianos de uso habitual, registrando valores del 20,8% para la ampicilina, el 23,5% para las sulfonamidas y el 21,8% para las tetraciclinas. A nivel de la producción primaria, la resistencia a estos mismos compuestos osciló entre moderada y muy alta en la mayoría de los Estados miembros en cerdos de engorde, terneros, pollos de engorde y pavos, con la notable excepción de las gallinas ponedoras, donde los niveles detectados fueron significativamente más bajos.

Es motivo de especial escrutinio la resistencia a la ciprofloxacina, catalogada como un antimicrobiano de importancia crítica. En 2024, el 21,4% de los aislados de Salmonella en humanos fueron resistentes a este fármaco. Esta resistencia se dispara a niveles considerados extremadamente altos en ciertos serovares específicos, como S. Kentucky, que registró un asombroso 79,1% de resistencia en infecciones humanas. Gran parte de estos aislados de S. Kentucky mostraron además resistencia de alto nivel, estando predominantemente asociados al clon epidémico global ST198. Paralelamente, se ha detectado una tendencia temporal creciente (2014-2024) en la resistencia a la ciprofloxacina en S. Enteritidis en 15 países, un serovar que está estrechamente vinculado a la producción e industria avícola.

En cuanto a las cefalosporinas de tercera generación, como la cefotaxima y la ceftazidima, la resistencia se mantuvo en niveles globales bajos en humanos (1,8% y 1,5%, respectivamente) y muy bajos en los animales de granja. Sin embargo, el muestreo de carne fresca importada en los puestos de control fronterizos proyecta una imagen distinta, detectándose niveles muy altos de resistencia a estos compuestos críticos en aislados de Salmonella procedentes de carne de pollo y pavo importada de terceros países.

La multirresistencia (MDR) fue en general moderada (18,7%) entre las especies de Salmonella reportadas en humanos, variando sustancialmente según el serovar: desde un nivel bajo en S. Enteritidis (3,2%) hasta un nivel muy alto en la variante monofásica de S. Typhimurium (64,6%) y S. Kentucky (67,8%). En animales, la MDR alcanzó niveles altos en cerdos (43,3%) y pollos de engorde (35,1%).

La resistencia alarmante en Campylobacter spp.

Los datos confirman niveles de resistencia desde altos hasta extremadamente altos frente a las fluoroquinolonas tanto en Campylobacter jejuni como en Campylobacter coli aislados de pacientes humanos y de animales de abasto. En 2024, la resistencia media a la ciprofloxacina en infecciones humanas fue del 72,0% para C. jejuni y del 76,5% para C. coli. En el ámbito veterinario, los niveles de resistencia más dramáticos se observaron en aislados de C. coli provenientes de pavos de engorde (85,1%) y de terneros (80,4%). Esta penetración masiva de la resistencia compromete de forma severa y directa la utilidad clínica de esta clase de antibióticos.

La eritromicina muestra un panorama divergente. La resistencia a este compuesto se detectó en niveles catalogados de raros a bajos en C. jejuni tanto de origen humano como animal. No obstante, C. coli exhibe una mayor capacidad para evadir este antibiótico, alcanzando proporciones de resistencia del 5,1% en humanos y variando desde niveles bajos a altos en animales, con picos preocupantes del 31,6% en terneros durante 2023. El análisis genómico mediante secuenciación de genoma completo reveló que la principal causa subyacente de esta resistencia a la eritromicina en animales es la mutación A2075G en el gen del ARNr 23S, si bien también se detectó esporádicamente el gen transferible erm(B).

Al igual que con otros patógenos, la multirresistencia fue marcadamente mayor en C. coli que en C. jejuni. Mientras que en C. jejuni humano la MDR fue apenas del 0,7%, en C. coli de origen humano la cifra ascendió al 7,5%. En animales, C. coli también mostró niveles de multirresistencia elevados, tocando techo con un 34,8% en los aislados provenientes de terneros.

Bacterias indicadoras (E. coli) y microorganismos específicos (MRSA)

El monitoreo de Escherichia coli comensal indicadora en la flora intestinal de animales sanos proporciona un termómetro general indispensable sobre la presión selectiva ejercida por el uso de antibióticos en las granjas. En el bienio 2023-2024, la resistencia frente a la ampicilina, el sulfametoxazol, la trimetoprima y la tetraciclina fluctuó entre niveles altos y muy altos en las explotaciones avícolas y porcinas.

A pesar de estas altas tasas, los indicadores de resultados clave diseñados para evaluar las políticas de mitigación muestran un progreso palpable a largo plazo. La proporción de cepas con susceptibilidad completa (aislados sensibles a todo el panel de antimicrobianos ensayado) en E. coli ha aumentado significativamente en varios países a lo largo de los últimos diez años. De manera recíproca, la prevalencia de cepas de E. coli productoras de betalactamasas de espectro extendido (ESBL) o AmpC en animales vivos y carne ha mostrado tendencias decrecientes significativas a nivel comunitario. No obstante, los análisis estadísticos más recientes advierten que algunas de estas valiosas tendencias de declive se han estabilizado en una meseta, lo que obliga a las instituciones a no bajar la guardia.

El rastreo específico de cepas productoras de carbapenemasas mediante placas de cultivo selectivo logró detectar 70 microorganismos portadores de estos genes en 2023-2024. Estas cepas, portadoras de genes como $bla_{OXA-181}$, $bla_{OXA-48}$ y $bla_{NDM-5}$, provinieron primordialmente del sector porcino y de terneros.

Por su parte, la vigilancia del Staphylococcus aureus resistente a la meticilina evidenció que el complejo clonal 398 asociado a la ganadería sigue siendo el linaje hegemónico tanto en los animales productores de alimentos como en los productos cárnicos testados. Resulta un alivio constatar que no se detectó ninguna resistencia a la vancomicina en las cepas evaluadas, aunque sí aparecieron casos extremadamente raros y esporádicos de resistencia a antibióticos como linezolid y mupirocina. Las especies de Enterococcus también fueron monitorizadas, revelando marcadas variaciones geográficas y encontrándose resistencia a la vancomicina exclusivamente en cepas de E. faecium aisladas de terneros (1,5%) y cerdos (0,2%).


Declaraciones públicas

"Si bien los datos constatan un progreso alentador en la reducción de la resistencia a los antimicrobianos en los animales destinados a la producción de alimentos durante la última década, los niveles persistentemente altos de insensibilidad en patógenos zoonóticos exigen esfuerzos sostenidos. La estabilización reciente de algunas tendencias previamente favorables subraya la urgencia de mantener una vigilancia estricta y de continuar promoviendo el uso prudente y responsable de los antibióticos en todos los sectores."

Síntesis institucional basada en las conclusiones del informe resumen de la Unión Europea sobre la Resistencia a los Antimicrobianos (EFSA y ECDC).

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La Crónica del Henares: SALUD. La resistencia a los antimicrobianos en bacterias alimentarias: un desafío persistente para la salud pública europea en 2023-2024
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